故事讲述枪法一流但好色风流的孟波，及欢喜冤家槙村香共同经营以“城市猎人”为名的私人侦探事务所。只要在新宿车站的留言板上写下“城市猎人”的委托暗号“XYZ”，他们就会考虑你的委托。这次，“城市猎人”收到视频创作者安芝的委托，委托内容居然是寻找一只逃跑的猫咪。尽管这个委托看似平凡，却隐藏了不为人知的秘密，孟波被安芝的美貌所吸引，香则为高额的报酬心动不已。两人在寻找逃跑猫咪的过程中，逐渐发现事情并不简单...

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工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父...