故事的地点发生在这个整年都会不可思议地开着樱花而出名的新月型岛--初音岛。梦幻的初音岛上发生了不可思议的现象，本不会枯萎的樱花在一夜之间突然枯萎了。两年之后，樱花再度在初音岛上绽放。主人公朝仓纯一进入风见学园，继续过着校园生活。他的口头禅“好困”消失了，变成了勤勉努力，热衷体育的开朗青年。此时，他的两个妹妹，两年前离去的朝仓音梦.....

一次突发事故，二角人(人类的变异，拥有比人类更高级的能力)露西杀死警卫，逃出了研究所，并丧失了记忆，后被浩太和其表妹由香所收养。同时，研究所方面害怕露西的能力会危害人类的安全，先后派出特种部队和其他的二角人进行抓捕，一场抓捕与反抓捕的"游戏"由此展开，同时露西和浩太之间的关系也渐露端倪……...

　美幸和夏实分别完成一年的研修重返墨东署。跟著，区内接连发生多宗案件。　　先有葵双叶和赖子发现一批数量庞大的鎗械，继而发生交通灯神秘故障以及电话线不通的意外。　　后来，眾人在一次捣破走私鎗械交易的行动中发现一隻光碟，可是，其中的资料却无法开啟。那时候，一名神秘人致电墨东署他在隅田河的桥上放置了炸弹……！...

　　第1巻：メイドロボ「イルファ」のロケテストが向坂家で行われることに。 最新カメラを構え、願望叶って臨戦体勢の雄二。 しかし、そこには巨大な“越えられない壁”が…！？　　第2巻：貴明はクラスメートや環、このみたちと、海水浴へ行くことに。愛佳から一緒に行こうと誘われた妹・郁乃は、「姉貴の保護者」を宣言して参加する。愛佳の夏の日の恋とドタバタの行方は？　　第3巻：翌日に控える学園祭、生徒会長ささらの...

　　本作第1话的主要角色是爱佳，故事由她和贵明在图书室整理书库说起。两人为了克服彼此的异性恐惧而互相呼叫对方的名字，而结果是喜忧参半，此时，麻烦男雄二目睹了两人的暧昧行为，由此故事掀起了波澜……...